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DNASU質(zhì)粒庫(kù)可以減輕個(gè)體實(shí)驗(yàn)室存儲(chǔ)和維護(hù)質(zhì)粒數(shù)據(jù)和樣品的負(fù)擔(dān)，并將這些質(zhì)粒分發(fā)給世界各地的研究人員。DNASU目前擁有越來(lái)越多的200,000多種質(zhì)粒，其中包含來(lái)自600多種生物的基因，其中包括在LaBaer實(shí)驗(yàn)室中創(chuàng)建的克隆以及來(lái)自外部研究人員的各種克隆。我們還有兩個(gè)重要的合作。作為ORFeome Collaboration的創(chuàng)始成員，我們參與創(chuàng)建了數(shù)千種人類和小鼠基因，并且是ORFeome Collaboration質(zhì)粒和質(zhì)粒集合的關(guān)鍵分析者。自2006年起，作為PSI：Biology-Materials Repository，我們對(duì)NIGMS資助的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)倡議（PSI）研究人員創(chuàng)建的數(shù)萬(wàn)個(gè)表達(dá)就緒克隆進(jìn)行了序列驗(yàn)證和分發(fā)。
進(jìn)入我們實(shí)驗(yàn)室的每個(gè)樣品都經(jīng)過(guò)序列驗(yàn)證，每個(gè)質(zhì)粒的注釋都存儲(chǔ)在基于Oracle的數(shù)據(jù)庫(kù)中。樣品存儲(chǔ)在先進(jìn)的Brooks BioStore冷凍儲(chǔ)存和回收系統(tǒng)（由NIGMS ARRA資助資助）中，使我們能夠分離質(zhì)粒并快速檢索所需的質(zhì)粒。通過(guò)本網(wǎng)站可以搜索質(zhì)粒信息，點(diǎn)擊克隆ID或載體名稱即可找到有關(guān)每種質(zhì)粒的更多信息。我們通過(guò)我們的網(wǎng)站向超過(guò)550個(gè)實(shí)驗(yàn)室分發(fā)了200,000多種質(zhì)粒，從而使研究人員能夠?qū)ι飳W(xué)和疾病中基因和蛋白質(zhì)的功能作用進(jìn)行盡可能廣泛的實(shí)驗(yàn)。
除了分發(fā)材料外，MR還尋求簡(jiǎn)化MTA流程，以減少機(jī)構(gòu)存放或接收質(zhì)粒所需的時(shí)間。為了實(shí)現(xiàn)這一目標(biāo)，MR開(kāi)創(chuàng)了兩個(gè)文件，即存款人的協(xié)議，其中規(guī)定了使MR能夠從外部機(jī)構(gòu)分發(fā)存放的質(zhì)粒的條款，以及加速的過(guò)程MTA，這使得研究人員無(wú)需等待其機(jī)構(gòu)簽署MTA。未來(lái)，MR將繼續(xù)為研究人員提供PSI質(zhì)粒和數(shù)據(jù)，并將擴(kuò)展其加速的MTA網(wǎng)絡(luò)，以便研究人員能夠毫不拖延地接收PSI質(zhì)粒。
該蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)計(jì)劃的（PSI）的主要科學(xué)任務(wù)是使大多數(shù)蛋白質(zhì)的三維原子水平結(jié)構(gòu)，很容易從它們對(duì)應(yīng)的DNA序列的知識(shí)獲得。迄今為止，已有超過(guò)5,100種蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)被28個(gè)當(dāng)前和3個(gè)前大型結(jié)構(gòu)基因組學(xué)中心確定為NIGMS資助的PSI項(xiàng)目的一部分。2010年夏季開(kāi)始的PSI下一階段PSI：生物學(xué)的目標(biāo)是繼續(xù)解決蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)并將高通量結(jié)構(gòu)生物學(xué)應(yīng)用于重要的生物學(xué)問(wèn)題，其中包括鼓勵(lì)結(jié)構(gòu)生物學(xué)家和研究人員之間建立伙伴關(guān)系。生物，生物化學(xué)和/或分子社區(qū)
為了表達(dá)，純化，結(jié)晶和解決這些蛋白質(zhì)家族和生物靶標(biāo)的結(jié)構(gòu)，已經(jīng)產(chǎn)生了超過(guò)100,000個(gè)含有從宿主生物體獲得的基因組DNA克隆的基因的質(zhì)粒克隆。這些克隆中的許多對(duì)研究人員特別有價(jià)值，因?yàn)槲覀円呀?jīng)測(cè)試并記錄了它們產(chǎn)生蛋白質(zhì)的能力，包括蛋白質(zhì)是否可溶并且可以被純化。所有這些信息都可以通過(guò)DNASU捕獲和搜索。通過(guò)單擊CloneID并鏈接到PSI Structural Biology Knowledgebase和Protein Data Bank，也可以找到有關(guān)每個(gè)克隆的其他生物學(xué)和結(jié)構(gòu)信息。
該蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)計(jì)劃，材料倉(cāng)庫(kù)（PSI-MR），現(xiàn)在PSI：生物基材料庫(kù)，于2006年與存儲(chǔ)，維護(hù)和發(fā)布所有PSI的研究人員創(chuàng)造了超過(guò)10萬(wàn)個(gè)克隆的任務(wù)創(chuàng)建。此外，每個(gè)克隆在進(jìn)行分發(fā)之前都經(jīng)過(guò)序列驗(yàn)證，確保發(fā)送給研究人員的克隆是正確的。截至2014年2月，超過(guò)82,000個(gè)PSI質(zhì)粒可供分發(fā)。
DNASU產(chǎn)品介紹
| 物/收藏品名稱 | 向量 | 集合中的克隆數(shù)量 | 學(xué)術(shù)/非營(yíng)利機(jī)構(gòu) | 所有其他 研究員 |
|---|---|---|---|---|
| 90/90人類ORFeome V1 - 完整系列 | 90/90人類ORFeome V 1（網(wǎng)關(guān)入口矢量） - 完整集合 | 1,1368 | $ 28420 | $ 39788 |
| 90/90人類ORFeome V 1（網(wǎng)關(guān)表達(dá)載體：pANT7 cGST） - 完整集合 | 10,853 | $ 27132.50 | $ 37985.50 | |
| 90/90人類ORFeome V1 - 膜蛋白 | 90/90人類ORFeome V 1（網(wǎng)關(guān)進(jìn)入載體） - 膜蛋白質(zhì)子收集 | 4187 | $ 10467.50 | $ 14654.50 |
| 90/90人ORFeome V 1（Gateway表達(dá)載體：pANT7 cGST） - 膜蛋白Sub集合 | 10,853 | $ 27132.50 | $ 37985.50 | |
| 90/90人類ORFeome V1 - 轉(zhuǎn)錄因子 | 90/90人類ORFeome V 1（網(wǎng)關(guān)條目向量） - 轉(zhuǎn)錄因子子集 | 1500 | $ 3750 | $ 5250 |
| 90/90人ORFeome V 1（Gateway表達(dá)載體：pANT7 cGST） - 轉(zhuǎn)錄因子Sub集合 | 1342 | $ 3355 | $ 4697 | |
| 90/90人類ORFeome V1 - 其他ORFs | 90/90人類ORFeome V 1（網(wǎng)關(guān)條目向量） - 其他ORFs子集 | 5,682 | $ 14205 | $ 19887 |
| 90/90人類ORFeome V 1（網(wǎng)關(guān)表達(dá)載體：pANT7 cGST） - 其他子集合 | 5605 | $ 14012.50 | $ 19617.50 | |
| 1000個(gè)與人乳腺癌相關(guān)的基因組 | pDNR-Dual，C端子標(biāo)簽 | 1155 | $ 2887.50 | $ 4042.50 |
| pDNR-Dual，全套 | 2,201 | $ 5502.50 | $ 7703.5 | |
| pDNR-Dual，無(wú)標(biāo)記 | 1046 | $ 2615 | $ 3661 | |
| 人類激酶集合 | pDNR雙，全套 | 632 | $ 1580年 | $器2212 |
| pDNR雙C端子標(biāo)簽 | 543 | $ 1357.5 | $ 1900.50 | |
| pJP1520逆轉(zhuǎn)錄病毒載體 | 651 | $ 1627.50 | $ 2278.50 | |
| pJP1563逆轉(zhuǎn)錄病毒載體 | 636 | $ 1590年 | $ 2226 | |
| 人類轉(zhuǎn)錄因子的收集 | pLenti6.2 / V5-DEST慢病毒載體 | 981 | $ 2452.50 | $ 3433.50 |
| 人類ORFeome V8.1 | pENTR223網(wǎng)關(guān)入門(mén)載體質(zhì)粒集合 | 12791 | $ 31977.50 | $ 44768.50 |
| pLX304 lentivrial表達(dá)集合 | 13,242 | $ 33105 | $ 46347 | |
| 人類表達(dá)克隆集合 | pANT_cGST無(wú)細(xì)胞表達(dá)與C末端GST標(biāo)簽 | 12326 | $ 30815 | $ 43141 |
| 具有Flag標(biāo)簽的pLDNT7_nFLAG無(wú)細(xì)胞表達(dá)載體 | 2123 | $ 5307.50 | $ 7430.50 | |
| 使用GST和Flag標(biāo)記的載體完成收集 | 2688 | $ 6720 | $ 9408 | |
| 炭疽桿菌 | pANT_cGST無(wú)細(xì)胞表達(dá)與C末端GST標(biāo)簽 | 4,708 | $ 11770 | $ 16478 |
| pDONR221載體 | 5341 | $ 13352.5 | $ 18693.50 | |
| Francisella tularensis | pDEST17大腸桿菌表達(dá)載體 | 1464 | $器3660 | $ 5124這兩款 |
| pDONR221載體 | 1507 | $ 3767.50 | $ 5274.50 | |
| pBY011_GFP-NH3_CN帶標(biāo)簽的酵母表達(dá)載體 | 1333 | $ 3332.50 | $ 4665.50 | |
| 銅綠假單胞菌 | pDONR201載體 | 2383 | $ 5957.50 | $ 8340.50 |
| 釀酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | ZM552表達(dá)載體 | 5092 | $ 12730 | $ 17822 |
| pBY011表達(dá)載體 | 5529 | $ 13837.50 | $ 19372.50 | |
| pDONR201或221載體 | 5,333 | $ 13332.50 | $ 18665.50 | |
| 霍亂弧菌 | pANT_cGST無(wú)細(xì)胞表達(dá)與C末端GST標(biāo)簽 | 3,310 | $ 8275 | $ 11585 |
| pDONR221載體 | 3,777 | $ 9442.50 | $ 13219.50 | |
| 鼠疫耶爾森氏菌 | pDONR221載體 | 3,968 | $ 9920 | $ 13888 |
| 耶爾森氏菌假結(jié)核 | pDONR221載體 | 271 | $ 677.50 | $ 948.50 |
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